工地上的元宵节:包汤圆、猜灯谜,我们与工友共度佳节!
12月2日上午,校党委常务副书记、学校党的二十大精神宣讲团成员裘新到复旦大学出版社,作党的二十大精神专题宣讲。
中山医院此前连续两年获得全国三级公立医院绩效考核前两名佳绩后,又在创建综合类国家医学中心的征程上率先发力。▲中山医院医教研综合大楼效果图目前,中山医院已在四个方向梳理出多项卡脖子、临门一脚攻关项目,与60多家国内企业签约共同攻关,通过医工合作,持续推动高水平基础医学研究与临床研究成果转化。
2021年5月起,中山医院参加了多次国家发展改革委和国家卫生健康委组织的评审会,上报的国家医学中心建设方案获得好评。今年8月31日,中山医院国家医学中心建设项目正式获得国家发展改革委批复立项。今天(11月18日)上午,全国首个综合类国家医学中心建设项目在复旦大学附属中山医院启动。上海国际医学科创中心位于徐汇区斜土路,设置有500张研究型床位,建设有医工交叉技术创新中心、临床诊疗前沿技术创新中心、临床试验服务平台、人才交流和成果转化平台等功能平台,将进一步吸引和培养高层次的科研人员参与推动医学研究成果加速转化。上海国际医学科创中心效果图青浦新城院区位于青浦区青浦大道,在长三角一体化发展示范区内,按照一次规划、一次设计、分期实施的原则,一期实施建设床位600张,建设有高质量临床诊疗中心、面向全国的公共卫生中心、国际交流合作中心等设施平台,将进一步推进多模态智慧医疗的应用、多学科肿瘤的防治、医防融合公共卫生体系建设和医学国际交流与合作。
国家医学中心是卫生健康领域的国之重器,是提升我国整体卫生健康水平、深度参与国际医学竞争的新载体。上海国际医学科创中心工程和青浦新城一期工程计划于2022年底开工,于2025年投入使用Zhe Zhou, Yanxiang Bi, Junpeng Wan, Yangfan Zhou, Zhou Li. Userspace Bypass: Accelerating Syscall-intensive Applications. The 17th USENIX Symposium on Operating Systems Design and Implementation (OSDI), 2023. 制图:实习编辑:沈家怡责任编辑:李斯嘉。
测试结果显示,纯I/O线程最多可被加速88.3%。OSDI的录用非常严格,平均每届仅录用30-40篇论文,其中来自中国大陆的第一作者论文更是屈指可数。提出用户态穿透(Userspace Bypass, UB)方案用来加速高频I/O应用。广泛应用与大数据处理、人工智能场景的MapReduce、Tensorflow等平台均发表于OSDI。
包括数据库软件Redis、网页服务器Nginx在内的网络空间的软件基础设施在不需要做任何修改的情况下都可获得最多10%以上的加速。OSDI(操作系统设计与实现研讨会)是计算机系统领域顶级的国际学术会议之一,被誉为计算机系统领域的奥斯卡,汇集了全球学术界和产业界系统领域专业人士的前沿思考和突破性成果,拥有极高的学术地位和业界影响力。
近日,由复旦大学计算机科学技术学院青年副研究员周喆、教授周扬帆、毕研翔和万俊鹏同学以及加州大学尔湾分校李洲老师合作的1篇论文被OSDI 2023(17th USENIX Symposium on Operating Systems Design and Implementation)提前批次接收,这是复旦大学首次在 OSDI 会议上以第一作者单位发表的学术成果,OSDI 会议将于2023年7月10日至12日在美国波士顿召开。操作系统在内核态与用户态之间的切换会对高频I/O任务产生非常大的开销。未来待UB大规模部署后,数以亿计的云端服务器均可获得性能提升。论文针对如何加速高频I/O任务这一问题展开研究,提出了用户态穿透(Userspace Bypass, UB)方案。
UB利用软件错误隔离技术(SFI)透明地以在线的方式(JIT)将用户态代码翻译成对内核无害的指令,并在内核内直接执行,可以实现对高频I/O应用的加速,并且完全不需要修改应用程序,达到二进制级别的兼容性。现阶段的多种优化方案将内核从I/O路径中移除或者将多个I/O请求打包提交。然而这些方案与现有软件生态不兼容,需要开发人员重构大量的软件代码。该方案不仅能够大大加速高频I/O任务还能够适配现有的软件系统,具有极强的实用性
UB利用软件错误隔离技术(SFI)透明地以在线的方式(JIT)将用户态代码翻译成对内核无害的指令,并在内核内直接执行,可以实现对高频I/O应用的加速,并且完全不需要修改应用程序,达到二进制级别的兼容性。论文针对如何加速高频I/O任务这一问题展开研究,提出了用户态穿透(Userspace Bypass, UB)方案。
这类开销在KPTI等安全防御机制打开后变得更大。操作系统在内核态与用户态之间的切换会对高频I/O任务产生非常大的开销。
包括数据库软件Redis、网页服务器Nginx在内的网络空间的软件基础设施在不需要做任何修改的情况下都可获得最多10%以上的加速。现阶段的多种优化方案将内核从I/O路径中移除或者将多个I/O请求打包提交。测试结果显示,纯I/O线程最多可被加速88.3%。广泛应用与大数据处理、人工智能场景的MapReduce、Tensorflow等平台均发表于OSDI。该方案不仅能够大大加速高频I/O任务还能够适配现有的软件系统,具有极强的实用性。近日,由复旦大学计算机科学技术学院青年副研究员周喆、教授周扬帆、毕研翔和万俊鹏同学以及加州大学尔湾分校李洲老师合作的1篇论文被OSDI 2023(17th USENIX Symposium on Operating Systems Design and Implementation)提前批次接收,这是复旦大学首次在 OSDI 会议上以第一作者单位发表的学术成果,OSDI 会议将于2023年7月10日至12日在美国波士顿召开。
OSDI的录用非常严格,平均每届仅录用30-40篇论文,其中来自中国大陆的第一作者论文更是屈指可数。提出用户态穿透(Userspace Bypass, UB)方案用来加速高频I/O应用。
然而这些方案与现有软件生态不兼容,需要开发人员重构大量的软件代码。OSDI(操作系统设计与实现研讨会)是计算机系统领域顶级的国际学术会议之一,被誉为计算机系统领域的奥斯卡,汇集了全球学术界和产业界系统领域专业人士的前沿思考和突破性成果,拥有极高的学术地位和业界影响力。
未来待UB大规模部署后,数以亿计的云端服务器均可获得性能提升。Zhe Zhou, Yanxiang Bi, Junpeng Wan, Yangfan Zhou, Zhou Li. Userspace Bypass: Accelerating Syscall-intensive Applications. The 17th USENIX Symposium on Operating Systems Design and Implementation (OSDI), 2023. 制图:实习编辑:沈家怡责任编辑:李斯嘉
近年来也有报道在皮肤、神经发育等过程中,PRC1可参与基因表达的激活。2022年11月21日,复旦大学基础医学院孙宁实验室和复旦大学生物医学研究院(IBS)蓝斐实验室在《发育细胞》(Developmental Cell)在线发表论文Essential role of MESP1-RING1A complex in cardiac differentiation,发现转录因子MESP1结合表观因子RING1A在心脏发育中共同发挥重要作用。总之,这些研究不仅证明了MESP1-RING1A在心脏发育中的重要性,同时也为MESP1,PRC1 和 cohesin组分突变导致先天性心脏病的机制提供了可能的解释。并发现RING1A在人类心肌细胞体外分化和小鼠心脏发育过程中发挥重要作用:RING1A缺失会导致人类心肌体外分化效率、收缩蛋白表达、钙处理能力等的下降。
转录因子MESP1在发育早期瞬时表达,调控心脏前体细胞(cardiac progenitor)等的产生,但其激活早期心脏发育基因的机制仍待研究。心脏发育受到很多基因的逐级精密调控,这些基因的突变与先天性心脏病的发生密切相关。
PRC1复合体的经典作用是抑制基因表达。复旦大学基础医学院梁倩倩青年副研究员、生物医学研究院王司清博士和基础医学院博士生周心妍为共同第一作者。
本研究发现MESP1-RING1A可与cohesin复合体、p300结合,通过调控A/B区室(compartment A/B)转换、增强子-启动子的染色质相互作用(chromatin interaction)、组蛋白乙酰化,激活心脏发育相关基因的表达。转录因子MESP1与表观遗传因子RING1A协同调控早期心脏发育孙宁教授和蓝斐研究员为论文共同通讯作者。
先天性心脏病是新生儿最常见的出生缺陷,发病率高达0.4%~1%,也是婴幼儿死亡的主要原因之一。Ring1A敲除小鼠此前只报道过中轴骨发育异常,本研究发现Ring1A敲除小鼠出现与MESP1突变病人类似的先天性心脏病表型,如主动脉骑跨、室间隔缺损、肺动脉狭窄、致密化心室壁变薄等。本研究首次发现MESP1可与PRC1核心蛋白RING1A相互作用,协同结合并激活人类心脏早期发育相关基因表达,如中胚层形成相关基因WNT5A、NCAM1、LEF1、ZEB2、MEIS1、MEIS2、PDGFRA、GATA6,与心脏谱系基因MYOCD和MEF2C。已有报道在先天性心脏病病人中,发现了MESP1多个位点的单等位基因突变(single-allele mutation),表观遗传因子PRC1(Polycomb repressive complex 1)复合体、黏连蛋白(cohesin)复合体的多个组分也报道存在先天性心脏病致病突变,而这些组分在心脏发育中的具体作用机制还不清楚。
本研究同时发现,MESP1致病突变会影响MESP1与RING1A、cohesin组分的结合,影响心脏发育基因的表达及心肌的正常分化。研究还得到了广东省人民医院的朱平教授、纪念斯隆-凯特琳癌症中心的徐一驰博士等合作者的大力支持
研究还得到了广东省人民医院的朱平教授、纪念斯隆-凯特琳癌症中心的徐一驰博士等合作者的大力支持。转录因子MESP1与表观遗传因子RING1A协同调控早期心脏发育孙宁教授和蓝斐研究员为论文共同通讯作者。
本研究发现MESP1-RING1A可与cohesin复合体、p300结合,通过调控A/B区室(compartment A/B)转换、增强子-启动子的染色质相互作用(chromatin interaction)、组蛋白乙酰化,激活心脏发育相关基因的表达。总之,这些研究不仅证明了MESP1-RING1A在心脏发育中的重要性,同时也为MESP1,PRC1 和 cohesin组分突变导致先天性心脏病的机制提供了可能的解释。